С начала 20 века мощи праведного Симеона Верхотурского, всея Сибири чудотворца, находились в разное время в трёх храмах Свято-Николаевской обители: сначала покоились в старом Никольском соборе, позднее разрушенном большевиками; потом в построенном величественном Крестовоздвиженском соборе; после возрождения монастыря в постсоветские годы – в Преображенском соборе; а затем рака с мощами была вновь перенесена в главный храм монастыря – Крестовоздвиженский собор.